突然，面前出现了阴影——那是零号机举着大盾挡在在初号机面前。
“绫波零！”真嗣大喊。
“能量续上来了吗？！”美里急忙问道。
“五、六区域电力运输系统运转正常，能量已经蓄满，还有5分钟准备！”日向诚答道。
真嗣盯着面前出现的中央标记，身体向前绷直，手也紧紧握住操作杆，同步率也加深了些。
零一个人待在冰冷还未通电的插入栓内，身体蜷缩在一起。
“感觉，感觉好奇怪。为什么身体这么冷，眼睛里却还滚涌着热气？是藤野君说的泪吗？”零身体颤抖地自言自语。
“不是他说的！他已经死了，你已经没有任何对他的情感，也不会再有了，只有对碇司令的，只有对碇司令的”零心中突然有了回应，似乎是为了修补被突破的心灵封锁，可无论如何在心中暗示多少遍，封锁的缺口并没有出现恢复的状态，反而越来越大。
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“是他说的，他还说过：我是绫波零，我是绫波零，我是”她头开始疼痛，眼前也出现了无数个自己，它们不断用手卡住自己所见的各个时期藤野的脖子，同时每个自己都在出“哈哈哈哈”的笑声，都在说着“敌人！敌人！碇司令的敌人！你也想要成为碇司令的敌人吗？”的话语，可越是这样零越是记得那句话，越是想要将其说出来：
“他还说藤野君还说我是自由无约束的啊啊啊啊啊啊啊啊啊！！！！”零只感觉到精神开始崩坏，大量停留在外的记忆从心灵封锁的破损处涌入，在里面不断碰撞恢复成一个个片段。这使她变得开始有些扭曲，面部表情也不断改变着，仿佛是第一次对这些记忆进行反应和体会。
周围开始变亮，屏幕中终于显示出外面的场景。绫波零忍住疼痛将头抬起看过去，此时雷天使又一炮弹射向初号机，可初号机为了保持最佳位置被完全固定在地面上无法动弹。虽然零号机的一切的通讯都被磁场干扰切断，但在没有任何命令的情况下，零下意识就立马驾驶着拿起盾牌挡在初号机的面前。
激光削平一座座山峰向着零号机手中的盾牌射去，“轰”地在盾牌中央爆炸，大量的能量向四周散开，不断产生的冲击波让零号机不得不带起土块灰尘向后退去。
随着时间的流逝，盾牌不断被熔化，零号机手掌处的保护层也开始生燃烧脱落。
“还有多久？！”美里急忙问。
“还差3分钟。”日向诚答道。
“不行，时间根本不够。”站在美里后面的赤木律子博士说道，“现在零号机所带的盾牌估计还有十几秒就要被熔化完全，没办法继续抵挡。”
“那怎么办？”美里回过头去，但看到律子那副严肃无奈的表情不免有些震惊。
“你难道想要让零去死吗？”美里不可置信地问道。
律子点了点头，同时对着监控说道：
“司令，我想你也会同意的吧？”
坐在基地里的碇源堂点了点头，没有半点异议。
“那零自己呢？先不说她是不是愿意，她没有接到命令怎么确定她会去执行这样的任务呢？”美里希望说服他们改变想法，但律子却看向视频里的零号机，充满自信地说：
“我想，她会明白她被设定好的使命。”
激光终究穿透了盾牌，直直灼烧在零号机身上。不仅零号机的拘束器化作滴滴铁水向下掉落，炽热滚烫的感觉也遍布零的全身。零绷直了自己的身子，脸上虽然露出平常痛苦的表情，但心中却在仔细品味着这第一次所感受到的令人在意的疼痛——害怕。
零想要操作零号机举起双手挡在自己前面进行抵挡，但是最后的心灵封锁被启动，阻止着自己想要求生的行动。这时的零感受到了死亡的可怕，但面容却很是平静，似乎早就有了预料。
激光穿透了拘束器，开始灼烧起机体内部。零的五脏六腑都开始感受到无与伦比的疼痛，大脑不停出死亡预警的信号，自然也开始急忙找寻属于零的记忆开始回放，进行类似走马灯的操作，但对于刚吸收大量杂乱记忆的零的心灵来说，只有一段记忆被完整还原了逻辑并呈现了出来。
9号病房内，绫波零还是如往常般因为实验而受伤，静静地躺在不怎么舒适的病床上。如果按照平时的话，自己必须一个人睁着眼呆在这被刺眼白光充斥的房间中两三天。
“啾啾”餐车轮子滚动的声音不断响起，直至门口才停下。
房门被打开，餐车也被推了进来，只不过并没有看到任何高大的医护人员，只有一个孩子——比自己还矮的孩子。
“你是谁？”零又转过头去盯着天花板无力地问道，语气中带有不小的警戒。
那个孩子先是惊讶地看到躺在床上的零，眼神有些被她的外貌吸引，但还是立马反应过来，对自己鞠了一躬打招呼道：